Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms