Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms