Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms