Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

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Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms