Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pfdn6Q03958 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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