Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnb1Q03717 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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