Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Runx1Q03347 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms