Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms