Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms