Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms