Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcc1P97496 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms