Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf1bP97358 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf1bP97358 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf1bP97358 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf1bP97358 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf1bP97358 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf1bP97358 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Taf1bP97358 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Taf1bP97358 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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