Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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