Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms