Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms