Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CiitaP79621 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CiitaP79621 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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