Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms