Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NficP70255 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NficP70255 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NficP70255 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NficP70255 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NficP70255 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NficP70255 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NficP70255 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NficP70255 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NficP70255 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.2 ms