Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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