Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Snrpd1P62315 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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