Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms