Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms