Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpa1P57784 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms