Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtnsP57757 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtnsP57757 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CtnsP57757 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtnsP57757 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms