Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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