Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms