Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Map3k1P53349 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms