Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MipP51180 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MipP51180 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 467 ms