Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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