Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LmnaP48678 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LmnaP48678 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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