Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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