Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrprbP47758 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms