Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms