Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms