Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms