Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cap1P40124 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cap1P40124 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms