Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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TtlP38585 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TtlP38585 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TtlP38585 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtlP38585 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TtlP38585 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms