Protein–RNA interactions for Protein: P35385

Hspb7, Heat shock protein beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb7P35385 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hspb7P35385 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms