Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Mmp13P33435 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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