Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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