Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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