Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms