Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NapbP28663 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NapbP28663 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms