Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa3P28310 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms