Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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