Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms