Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pde6bP23440 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pde6bP23440 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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