Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P20040 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P20040 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms