Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NefhP19246 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms