Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18528 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18528 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
P18528 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18528 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18528 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms